Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ryr1E9PZQ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms