Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chd2E9PZM4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms