Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rsf1E9PWW9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rsf1E9PWW9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms