Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3002E9PW72 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms