Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cngb1E1AZ71 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cngb1E1AZ71 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms