Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh8D3Z6W3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms