Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms