Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3543D3Z235 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm3543D3Z235 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm3543D3Z235 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm3543D3Z235 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3543D3Z235 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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