Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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