Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms