Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp26c1B2RXA7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms