Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cspp1B2RX88 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cspp1B2RX88 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms