Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.79■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Abcc8B2RUS7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms