Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PtprbB2RU80 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprbB2RU80 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprbB2RU80 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprbB2RU80 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprbB2RU80 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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PtprbB2RU80 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprbB2RU80 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprbB2RU80 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PtprbB2RU80 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PtprbB2RU80 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PtprbB2RU80 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprbB2RU80 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprbB2RU80 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprbB2RU80 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprbB2RU80 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PtprbB2RU80 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PtprbB2RU80 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PtprbB2RU80 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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