Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms