Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms