Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp36B1AQJ2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms