Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trmt1lA2RSY6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trmt1lA2RSY6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms