Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms