Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms