Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ckap5A2AGT5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms