Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pramef6A2A8M8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Pramef6A2A8M8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Pramef6A2A8M8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Pramef6A2A8M8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Pramef6A2A8M8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms