Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm2A2A7B5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm2A2A7B5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms