Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul4bA2A432 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms