Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms