Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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