Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms