Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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