Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-3,71□□□□□ -3
Nphp1Q9QY53 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC-3,71□□□□□ -3
Nphp1Q9QY53 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-3,76□□□□□ -3,01
Nphp1Q9QY53 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-3,79□□□□□ -3,02
Nphp1Q9QY53 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC-3,8□□□□□ -3,02
Nphp1Q9QY53 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC-3,8□□□□□ -3,02
Nphp1Q9QY53 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-3,81□□□□□ -3,02
Nphp1Q9QY53 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-3,86□□□□□ -3,03
Nphp1Q9QY53 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-3,91□□□□□ -3,04
Nphp1Q9QY53 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-3,99□□□□□ -3,05
Nphp1Q9QY53 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-4□□□□□ -3,05
Nphp1Q9QY53 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-4,02□□□□□ -3,05
Nphp1Q9QY53 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-4,03□□□□□ -3,05
Nphp1Q9QY53 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-4,05□□□□□ -3,06
Nphp1Q9QY53 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-4,07□□□□□ -3,06
Nphp1Q9QY53 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-4,08□□□□□ -3,06
Nphp1Q9QY53 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-4,08□□□□□ -3,06
Nphp1Q9QY53 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-4,13□□□□□ -3,07
Nphp1Q9QY53 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-4,26□□□□□ -3,09
Nphp1Q9QY53 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-4,45□□□□□ -3,12
Nphp1Q9QY53 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-4,47□□□□□ -3,13
Nphp1Q9QY53 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-4,47□□□□□ -3,13
Nphp1Q9QY53 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-4,51□□□□□ -3,13
Nphp1Q9QY53 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-4,51□□□□□ -3,13
Nphp1Q9QY53 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-4,7□□□□□ -3,16
Nphp1Q9QY53 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-4,91□□□□□ -3,2
Nphp1Q9QY53 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-4,94□□□□□ -3,2
Nphp1Q9QY53 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-4,99□□□□□ -3,21
Nphp1Q9QY53 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-5,27□□□□□ -3,25
Nphp1Q9QY53 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-5,76□□□□□ -3,33
Nphp1Q9QY53 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-6□□□□□ -3,37
Nphp1Q9QY53 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-6,18□□□□□ -3,4
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 109,1 ms