Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
Opn4Q9QXZ9 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
Opn4Q9QXZ9 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
Opn4Q9QXZ9 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
Opn4Q9QXZ9 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
Opn4Q9QXZ9 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
Opn4Q9QXZ9 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
Opn4Q9QXZ9 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
Opn4Q9QXZ9 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
Opn4Q9QXZ9 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
Opn4Q9QXZ9 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
Opn4Q9QXZ9 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
Opn4Q9QXZ9 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
Opn4Q9QXZ9 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
Opn4Q9QXZ9 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Opn4Q9QXZ9 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
Opn4Q9QXZ9 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Opn4Q9QXZ9 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
Opn4Q9QXZ9 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
Opn4Q9QXZ9 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
Opn4Q9QXZ9 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
Opn4Q9QXZ9 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Opn4Q9QXZ9 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
Opn4Q9QXZ9 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
Opn4Q9QXZ9 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
Opn4Q9QXZ9 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
Opn4Q9QXZ9 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
Opn4Q9QXZ9 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
Opn4Q9QXZ9 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
Opn4Q9QXZ9 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
Opn4Q9QXZ9 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
Opn4Q9QXZ9 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.6 ms