Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-4,19□□□□□ -3,08
Ssc5dQ8BV57 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-4,19□□□□□ -3,08
Ssc5dQ8BV57 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-4,22□□□□□ -3,08
Ssc5dQ8BV57 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-4,26□□□□□ -3,09
Ssc5dQ8BV57 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-4,31□□□□□ -3,1
Ssc5dQ8BV57 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-4,35□□□□□ -3,11
Ssc5dQ8BV57 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-4,36□□□□□ -3,11
Ssc5dQ8BV57 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-4,37□□□□□ -3,11
Ssc5dQ8BV57 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Ssc5dQ8BV57 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC-4,5□□□□□ -3,13
Ssc5dQ8BV57 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-4,52□□□□□ -3,13
Ssc5dQ8BV57 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-4,53□□□□□ -3,13
Ssc5dQ8BV57 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-4,55□□□□□ -3,14
Ssc5dQ8BV57 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC-4,57□□□□□ -3,14
Ssc5dQ8BV57 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC-4,57□□□□□ -3,14
Ssc5dQ8BV57 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC-4,58□□□□□ -3,14
Ssc5dQ8BV57 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-4,6□□□□□ -3,15
Ssc5dQ8BV57 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC-4,71□□□□□ -3,16
Ssc5dQ8BV57 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-4,79□□□□□ -3,18
Ssc5dQ8BV57 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-4,92□□□□□ -3,2
Ssc5dQ8BV57 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-5,03□□□□□ -3,21
Ssc5dQ8BV57 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC-5,04□□□□□ -3,22
Ssc5dQ8BV57 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-5,05□□□□□ -3,22
Ssc5dQ8BV57 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-5,15□□□□□ -3,23
Ssc5dQ8BV57 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-5,28□□□□□ -3,25
Ssc5dQ8BV57 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-5,36□□□□□ -3,27
Ssc5dQ8BV57 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-5,56□□□□□ -3,3
Ssc5dQ8BV57 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-5,87□□□□□ -3,35
Ssc5dQ8BV57 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-5,98□□□□□ -3,37
Ssc5dQ8BV57 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-6,16□□□□□ -3,4
Ssc5dQ8BV57 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-6,44□□□□□ -3,44
Ssc5dQ8BV57 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-6,51□□□□□ -3,45
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,8 ms