Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-5,9□□□□□ -3,35
Tpm4Q6IRU2 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-5,93□□□□□ -3,36
Tpm4Q6IRU2 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-5,94□□□□□ -3,36
Tpm4Q6IRU2 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-5,99□□□□□ -3,37
Tpm4Q6IRU2 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-6□□□□□ -3,37
Tpm4Q6IRU2 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-6,02□□□□□ -3,37
Tpm4Q6IRU2 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-6,04□□□□□ -3,38
Tpm4Q6IRU2 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-6,06□□□□□ -3,38
Tpm4Q6IRU2 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-6,07□□□□□ -3,38
Tpm4Q6IRU2 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-6,1□□□□□ -3,39
Tpm4Q6IRU2 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-6,16□□□□□ -3,4
Tpm4Q6IRU2 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-6,17□□□□□ -3,4
Tpm4Q6IRU2 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-6,2□□□□□ -3,4
Tpm4Q6IRU2 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC-6,22□□□□□ -3,41
Tpm4Q6IRU2 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-6,28□□□□□ -3,41
Tpm4Q6IRU2 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-6,61□□□□□ -3,47
Tpm4Q6IRU2 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-6,68□□□□□ -3,48
Tpm4Q6IRU2 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-6,77□□□□□ -3,49
Tpm4Q6IRU2 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-6,89□□□□□ -3,51
Tpm4Q6IRU2 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-6,97□□□□□ -3,53
Tpm4Q6IRU2 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-6,99□□□□□ -3,53
Tpm4Q6IRU2 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-7,01□□□□□ -3,53
Tpm4Q6IRU2 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-7,01□□□□□ -3,53
Tpm4Q6IRU2 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-7,48□□□□□ -3,61
Tpm4Q6IRU2 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-7,53□□□□□ -3,61
Tpm4Q6IRU2 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-7,63□□□□□ -3,63
Tpm4Q6IRU2 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-7,92□□□□□ -3,68
Tpm4Q6IRU2 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-7,93□□□□□ -3,68
Tpm4Q6IRU2 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-8,63□□□□□ -3,79
Tpm4Q6IRU2 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-8,94□□□□□ -3,84
Tpm4Q6IRU2 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-8,98□□□□□ -3,85
Tpm4Q6IRU2 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-9,39□□□□□ -3,91
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 6 ms