Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-4,68□□□□□ -3,16
Sycp1Q62209 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-4,7□□□□□ -3,16
Sycp1Q62209 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC-4,76□□□□□ -3,17
Sycp1Q62209 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-4,76□□□□□ -3,17
Sycp1Q62209 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-4,84□□□□□ -3,18
Sycp1Q62209 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-4,89□□□□□ -3,19
Sycp1Q62209 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-4,91□□□□□ -3,2
Sycp1Q62209 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-4,92□□□□□ -3,2
Sycp1Q62209 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-4,94□□□□□ -3,2
Sycp1Q62209 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-4,97□□□□□ -3,21
Sycp1Q62209 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-4,98□□□□□ -3,21
Sycp1Q62209 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-4,99□□□□□ -3,21
Sycp1Q62209 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-5,09□□□□□ -3,22
Sycp1Q62209 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-5,12□□□□□ -3,23
Sycp1Q62209 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-5,15□□□□□ -3,23
Sycp1Q62209 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-5,16□□□□□ -3,24
Sycp1Q62209 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-5,48□□□□□ -3,29
Sycp1Q62209 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-5,52□□□□□ -3,29
Sycp1Q62209 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-5,56□□□□□ -3,3
Sycp1Q62209 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-5,56□□□□□ -3,3
Sycp1Q62209 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-5,58□□□□□ -3,3
Sycp1Q62209 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-5,71□□□□□ -3,32
Sycp1Q62209 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-5,84□□□□□ -3,34
Sycp1Q62209 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-5,99□□□□□ -3,37
Sycp1Q62209 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-6,08□□□□□ -3,38
Sycp1Q62209 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-6,2□□□□□ -3,4
Sycp1Q62209 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-6,29□□□□□ -3,42
Sycp1Q62209 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-6,51□□□□□ -3,45
Sycp1Q62209 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-6,66□□□□□ -3,48
Sycp1Q62209 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-7,25□□□□□ -3,57
Sycp1Q62209 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-7,36□□□□□ -3,59
Sycp1Q62209 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-7,65□□□□□ -3,63
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 5,9 ms