Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Trim71Q1PSW8 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Trim71Q1PSW8 Gm22402-201ENSMUST00000174920 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Trim71Q1PSW8 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Trim71Q1PSW8 Gm23751-201ENSMUST00000157583 136 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Trim71Q1PSW8 Gm26307-201ENSMUST00000157767 126 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Trim71Q1PSW8 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Trim71Q1PSW8 Gm23637-201ENSMUST00000175075 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Trim71Q1PSW8 Gm25248-201ENSMUST00000175473 98 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Trim71Q1PSW8 Gm24538-201ENSMUST00000082612 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Trim71Q1PSW8 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Trim71Q1PSW8 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Trim71Q1PSW8 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Trim71Q1PSW8 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Trim71Q1PSW8 Gm22385-201ENSMUST00000158189 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Trim71Q1PSW8 Gm23421-201ENSMUST00000158934 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Trim71Q1PSW8 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Trim71Q1PSW8 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Trim71Q1PSW8 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Trim71Q1PSW8 Mir466m-201ENSMUST00000175052 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Trim71Q1PSW8 Mir7218-201ENSMUST00000200050 59 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Trim71Q1PSW8 Gm25297-201ENSMUST00000175490 67 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Trim71Q1PSW8 Mir335-201ENSMUST00000083567 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Trim71Q1PSW8 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Trim71Q1PSW8 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Trim71Q1PSW8 Mir351-201ENSMUST00000083569 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Trim71Q1PSW8 Gm24047-201ENSMUST00000102405 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Trim71Q1PSW8 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
Trim71Q1PSW8 Gm22566-201ENSMUST00000175541 85 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Trim71Q1PSW8 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
Trim71Q1PSW8 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
Trim71Q1PSW8 Gm23335-201ENSMUST00000117021 90 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.9 ms