Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ptchd1Q14B62 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
ptchd1Q14B62 Mir7670-201ENSMUST00000183689 69 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ptchd1Q14B62 Gm23066-201ENSMUST00000158237 71 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ptchd1Q14B62 Gm22402-201ENSMUST00000174920 110 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ptchd1Q14B62 Gm22566-201ENSMUST00000175541 85 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ptchd1Q14B62 Gm27882-201ENSMUST00000184904 74 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
ptchd1Q14B62 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ptchd1Q14B62 Gm24538-201ENSMUST00000082612 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ptchd1Q14B62 Mir335-201ENSMUST00000083567 98 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
ptchd1Q14B62 Gm26231-201ENSMUST00000175218 67 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
ptchd1Q14B62 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
ptchd1Q14B62 Gm27995-201ENSMUST00000184402 100 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ptchd1Q14B62 Mir6395-201ENSMUST00000183885 91 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ptchd1Q14B62 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ptchd1Q14B62 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ptchd1Q14B62 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ptchd1Q14B62 Gm25297-201ENSMUST00000175490 67 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ptchd1Q14B62 Mir351-201ENSMUST00000083569 99 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ptchd1Q14B62 Gm26307-201ENSMUST00000157767 126 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ptchd1Q14B62 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ptchd1Q14B62 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ptchd1Q14B62 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ptchd1Q14B62 Mir154-201ENSMUST00000083514 66 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ptchd1Q14B62 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ptchd1Q14B62 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ptchd1Q14B62 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ptchd1Q14B62 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
ptchd1Q14B62 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
ptchd1Q14B62 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
ptchd1Q14B62 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
ptchd1Q14B62 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.2 ms