Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-4,25□□□□□ -3,09
Sdc4O35988 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-4,26□□□□□ -3,09
Sdc4O35988 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC-4,27□□□□□ -3,09
Sdc4O35988 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC-4,28□□□□□ -3,09
Sdc4O35988 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-4,3□□□□□ -3,1
Sdc4O35988 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-4,3□□□□□ -3,1
Sdc4O35988 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-4,33□□□□□ -3,1
Sdc4O35988 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-4,35□□□□□ -3,11
Sdc4O35988 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-4,37□□□□□ -3,11
Sdc4O35988 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-4,4□□□□□ -3,11
Sdc4O35988 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-4,41□□□□□ -3,12
Sdc4O35988 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Sdc4O35988 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-4,43□□□□□ -3,12
Sdc4O35988 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC-4,51□□□□□ -3,13
Sdc4O35988 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-4,52□□□□□ -3,13
Sdc4O35988 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-4,77□□□□□ -3,17
Sdc4O35988 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-4,79□□□□□ -3,18
Sdc4O35988 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-4,88□□□□□ -3,19
Sdc4O35988 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-4,93□□□□□ -3,2
Sdc4O35988 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-4,94□□□□□ -3,2
Sdc4O35988 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-5,05□□□□□ -3,22
Sdc4O35988 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-5,05□□□□□ -3,22
Sdc4O35988 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-5,07□□□□□ -3,22
Sdc4O35988 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-5,35□□□□□ -3,27
Sdc4O35988 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-5,37□□□□□ -3,27
Sdc4O35988 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-5,51□□□□□ -3,29
Sdc4O35988 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-5,7□□□□□ -3,32
Sdc4O35988 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-5,7□□□□□ -3,32
Sdc4O35988 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-6,21□□□□□ -3,4
Sdc4O35988 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-6,38□□□□□ -3,43
Sdc4O35988 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-6,45□□□□□ -3,44
Sdc4O35988 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-6,73□□□□□ -3,49
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 5,5 ms