Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Cdh18E9Q9Q6 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
Cdh18E9Q9Q6 Mir154-201ENSMUST00000083514 66 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
Cdh18E9Q9Q6 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
Cdh18E9Q9Q6 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
Cdh18E9Q9Q6 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
Cdh18E9Q9Q6 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
Cdh18E9Q9Q6 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
Cdh18E9Q9Q6 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
Cdh18E9Q9Q6 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
Cdh18E9Q9Q6 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
Cdh18E9Q9Q6 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
Cdh18E9Q9Q6 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
Cdh18E9Q9Q6 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
Cdh18E9Q9Q6 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
Cdh18E9Q9Q6 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
Cdh18E9Q9Q6 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
Cdh18E9Q9Q6 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
Cdh18E9Q9Q6 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
Cdh18E9Q9Q6 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
Cdh18E9Q9Q6 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
Cdh18E9Q9Q6 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
Cdh18E9Q9Q6 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
Cdh18E9Q9Q6 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
Cdh18E9Q9Q6 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Cdh18E9Q9Q6 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
Cdh18E9Q9Q6 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
Cdh18E9Q9Q6 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
Cdh18E9Q9Q6 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
Cdh18E9Q9Q6 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
Cdh18E9Q9Q6 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.4 ms