Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Ccdc170D3YXL0 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC-4,43□□□□□ -3,12
Ccdc170D3YXL0 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-4,44□□□□□ -3,12
Ccdc170D3YXL0 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-4,44□□□□□ -3,12
Ccdc170D3YXL0 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-4,49□□□□□ -3,13
Ccdc170D3YXL0 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-4,5□□□□□ -3,13
Ccdc170D3YXL0 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC-4,51□□□□□ -3,13
Ccdc170D3YXL0 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC-4,51□□□□□ -3,13
Ccdc170D3YXL0 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC-4,51□□□□□ -3,13
Ccdc170D3YXL0 Gm22127-201ENSMUST00000083239 106 ntBASIC-4,54□□□□□ -3,14
Ccdc170D3YXL0 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-4,59□□□□□ -3,14
Ccdc170D3YXL0 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-4,59□□□□□ -3,14
Ccdc170D3YXL0 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-4,61□□□□□ -3,15
Ccdc170D3YXL0 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-4,61□□□□□ -3,15
Ccdc170D3YXL0 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-4,68□□□□□ -3,16
Ccdc170D3YXL0 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-4,78□□□□□ -3,17
Ccdc170D3YXL0 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-4,9□□□□□ -3,19
Ccdc170D3YXL0 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-4,9□□□□□ -3,19
Ccdc170D3YXL0 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-5,01□□□□□ -3,21
Ccdc170D3YXL0 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-5,06□□□□□ -3,22
Ccdc170D3YXL0 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-5,23□□□□□ -3,25
Ccdc170D3YXL0 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-5,23□□□□□ -3,25
Ccdc170D3YXL0 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-5,26□□□□□ -3,25
Ccdc170D3YXL0 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-5,26□□□□□ -3,25
Ccdc170D3YXL0 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-5,4□□□□□ -3,27
Ccdc170D3YXL0 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-5,76□□□□□ -3,33
Ccdc170D3YXL0 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-5,86□□□□□ -3,35
Ccdc170D3YXL0 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-5,96□□□□□ -3,36
Ccdc170D3YXL0 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-6,12□□□□□ -3,39
Ccdc170D3YXL0 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-6,64□□□□□ -3,47
Ccdc170D3YXL0 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-6,87□□□□□ -3,51
Ccdc170D3YXL0 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-7,32□□□□□ -3,58
Retrieved 32 of 76,532 protein–RNA pairs in 155,6 ms