Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-3,59□□□□□ -2,98
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-3,63□□□□□ -2,99
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC-3,64□□□□□ -2,99
Trbv1A0A0B4J1G7 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-3,67□□□□□ -3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-3,7□□□□□ -3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-3,73□□□□□ -3,01
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-3,73□□□□□ -3,01
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-3,75□□□□□ -3,01
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-3,78□□□□□ -3,01
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-3,8□□□□□ -3,02
Trbv1A0A0B4J1G7 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-3,8□□□□□ -3,02
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-3,83□□□□□ -3,02
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-3,95□□□□□ -3,04
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-3,96□□□□□ -3,04
Trbv1A0A0B4J1G7 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC-3,97□□□□□ -3,04
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-3,98□□□□□ -3,05
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-4,14□□□□□ -3,07
Trbv1A0A0B4J1G7 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-4,2□□□□□ -3,08
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-4,2□□□□□ -3,08
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-4,23□□□□□ -3,09
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-4,24□□□□□ -3,09
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-4,32□□□□□ -3,1
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-4,32□□□□□ -3,1
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-4,51□□□□□ -3,13
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-4,66□□□□□ -3,16
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-4,74□□□□□ -3,17
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-4,95□□□□□ -3,2
Trbv1A0A0B4J1G7 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-5,01□□□□□ -3,21
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-5,07□□□□□ -3,22
Trbv1A0A0B4J1G7 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-5,4□□□□□ -3,27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-5,79□□□□□ -3,34
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-5,8□□□□□ -3,34
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