Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Y3

Ighv1-80, Immunoglobulin heavy variable 1-80 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC-4,32□□□□□ -3,1
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC-4,32□□□□□ -3,1
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-4,35□□□□□ -3,11
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-4,35□□□□□ -3,11
Ighv1-80A0A075B5Y3 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-4,38□□□□□ -3,11
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-4,44□□□□□ -3,12
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-4,51□□□□□ -3,13
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-4,54□□□□□ -3,14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-4,55□□□□□ -3,14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-4,56□□□□□ -3,14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC-4,58□□□□□ -3,14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-4,58□□□□□ -3,14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-4,61□□□□□ -3,15
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-4,61□□□□□ -3,15
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC-4,84□□□□□ -3,18
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-4,88□□□□□ -3,19
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-4,88□□□□□ -3,19
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-4,89□□□□□ -3,19
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-5□□□□□ -3,21
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC-5,06□□□□□ -3,22
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-5,17□□□□□ -3,24
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC-5,3□□□□□ -3,26
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-5,43□□□□□ -3,28
Ighv1-80A0A075B5Y3 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-5,46□□□□□ -3,28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC-5,61□□□□□ -3,31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-5,68□□□□□ -3,32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm23248-201ENSMUST00000083367 108 ntBASIC-5,82□□□□□ -3,34
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-5,92□□□□□ -3,36
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC-5,94□□□□□ -3,36
Ighv1-80A0A075B5Y3 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC-6,59□□□□□ -3,46
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-6,82□□□□□ -3,5
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC-7□□□□□ -3,53
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