Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC-3,76□□□□□ -3,01
Scn8aQ9WTU3 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC-3,78□□□□□ -3,01
Scn8aQ9WTU3 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3,78□□□□□ -3,01
Scn8aQ9WTU3 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC-3,79□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC-3,8□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-3,81□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC-3,81□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC-3,82□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC-3,82□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC-3,82□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC-3,83□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC-3,83□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC-3,83□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC-3,83□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC-3,83□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC-3,83□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC-3,83□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC-3,84□□□□□ -3,02
Scn8aQ9WTU3 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC-3,85□□□□□ -3,03
Scn8aQ9WTU3 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC-3,85□□□□□ -3,03
Scn8aQ9WTU3 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC-3,86□□□□□ -3,03
Scn8aQ9WTU3 Gm22056-201ENSMUST00000083386 81 ntBASIC-3,89□□□□□ -3,03
Scn8aQ9WTU3 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC-3,9□□□□□ -3,03
Scn8aQ9WTU3 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC-3,93□□□□□ -3,04
Scn8aQ9WTU3 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC-3,93□□□□□ -3,04
Scn8aQ9WTU3 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC-3,94□□□□□ -3,04
Scn8aQ9WTU3 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC-3,94□□□□□ -3,04
Scn8aQ9WTU3 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC-3,96□□□□□ -3,04
Scn8aQ9WTU3 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC-3,96□□□□□ -3,04
Scn8aQ9WTU3 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3,98□□□□□ -3,05
Scn8aQ9WTU3 Gm11966-201ENSMUST00000119907 87 ntBASIC-4,01□□□□□ -3,05
Scn8aQ9WTU3 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC-4,03□□□□□ -3,05
Scn8aQ9WTU3 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC-4,03□□□□□ -3,06
Scn8aQ9WTU3 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC-4,03□□□□□ -3,06
Scn8aQ9WTU3 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC-4,04□□□□□ -3,06
Scn8aQ9WTU3 Gm26139-201ENSMUST00000180098 107 ntBASIC-4,04□□□□□ -3,06
Scn8aQ9WTU3 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC-4,05□□□□□ -3,06
Scn8aQ9WTU3 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-4,06□□□□□ -3,06
Scn8aQ9WTU3 Gm25465-201ENSMUST00000157716 105 ntBASIC-4,06□□□□□ -3,06
Scn8aQ9WTU3 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC-4,07□□□□□ -3,06
Scn8aQ9WTU3 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC-4,07□□□□□ -3,06
Scn8aQ9WTU3 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC-4,07□□□□□ -3,06
Scn8aQ9WTU3 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-4,08□□□□□ -3,06
Scn8aQ9WTU3 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC-4,13□□□□□ -3,07
Scn8aQ9WTU3 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-4,13□□□□□ -3,07
Scn8aQ9WTU3 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC-4,16□□□□□ -3,07
Scn8aQ9WTU3 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC-4,16□□□□□ -3,07
Scn8aQ9WTU3 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-4,16□□□□□ -3,07
Scn8aQ9WTU3 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC-4,16□□□□□ -3,08
Scn8aQ9WTU3 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-4,17□□□□□ -3,08
Scn8aQ9WTU3 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC-4,18□□□□□ -3,08
Scn8aQ9WTU3 Gm24710-201ENSMUST00000175235 101 ntBASIC-4,22□□□□□ -3,08
Scn8aQ9WTU3 Gm24135-201ENSMUST00000179085 101 ntBASIC-4,22□□□□□ -3,08
Scn8aQ9WTU3 Gm23785-201ENSMUST00000116741 96 ntBASIC-4,23□□□□□ -3,09
Scn8aQ9WTU3 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC-4,23□□□□□ -3,09
Scn8aQ9WTU3 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC-4,24□□□□□ -3,09
Scn8aQ9WTU3 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC-4,24□□□□□ -3,09
Scn8aQ9WTU3 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC-4,24□□□□□ -3,09
Scn8aQ9WTU3 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC-4,25□□□□□ -3,09
Scn8aQ9WTU3 Gm26227-201ENSMUST00000082510 101 ntBASIC-4,27□□□□□ -3,09
Scn8aQ9WTU3 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC-4,31□□□□□ -3,1
Scn8aQ9WTU3 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-4,32□□□□□ -3,1
Scn8aQ9WTU3 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC-4,33□□□□□ -3,1
Scn8aQ9WTU3 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC-4,36□□□□□ -3,11
Scn8aQ9WTU3 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC-4,36□□□□□ -3,11
Scn8aQ9WTU3 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC-4,37□□□□□ -3,11
Scn8aQ9WTU3 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC-4,37□□□□□ -3,11
Scn8aQ9WTU3 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC-4,38□□□□□ -3,11
Scn8aQ9WTU3 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC-4,4□□□□□ -3,11
Scn8aQ9WTU3 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Scn8aQ9WTU3 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Scn8aQ9WTU3 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Scn8aQ9WTU3 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Scn8aQ9WTU3 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Scn8aQ9WTU3 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Scn8aQ9WTU3 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Scn8aQ9WTU3 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Scn8aQ9WTU3 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Scn8aQ9WTU3 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Scn8aQ9WTU3 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC-4,42□□□□□ -3,12
Scn8aQ9WTU3 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-4,44□□□□□ -3,12
Scn8aQ9WTU3 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC-4,49□□□□□ -3,13
Scn8aQ9WTU3 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC-4,49□□□□□ -3,13
Scn8aQ9WTU3 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC-4,53□□□□□ -3,13
Scn8aQ9WTU3 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-4,55□□□□□ -3,14
Scn8aQ9WTU3 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-4,56□□□□□ -3,14
Scn8aQ9WTU3 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-4,58□□□□□ -3,14
Scn8aQ9WTU3 Gm22127-201ENSMUST00000083239 106 ntBASIC-4,6□□□□□ -3,15
Scn8aQ9WTU3 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC-4,65□□□□□ -3,15
Scn8aQ9WTU3 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC-4,65□□□□□ -3,15
Scn8aQ9WTU3 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-4,7□□□□□ -3,16
Scn8aQ9WTU3 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-4,71□□□□□ -3,16
Scn8aQ9WTU3 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC-4,73□□□□□ -3,17
Scn8aQ9WTU3 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC-4,73□□□□□ -3,17
Scn8aQ9WTU3 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC-4,73□□□□□ -3,17
Scn8aQ9WTU3 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC-4,74□□□□□ -3,17
Scn8aQ9WTU3 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC-4,74□□□□□ -3,17
Scn8aQ9WTU3 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-4,77□□□□□ -3,17
Scn8aQ9WTU3 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC-4,77□□□□□ -3,17
Scn8aQ9WTU3 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC-4,78□□□□□ -3,18
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