Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3
Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22253-201 | ENSMUST00000179870 | 79 nt | BASIC | -4,81 | □□□□□ -3,18 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24378-201 | ENSMUST00000122699 | 106 nt | BASIC | -4,84 | □□□□□ -3,18 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir467g-201 | ENSMUST00000116906 | 120 nt | BASIC | -4,86 | □□□□□ -3,19 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir6481-201 | ENSMUST00000184617 | 110 nt | BASIC | -4,88 | □□□□□ -3,19 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25380-201 | ENSMUST00000175463 | 107 nt | BASIC | -4,89 | □□□□□ -3,19 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24641-201 | ENSMUST00000178055 | 107 nt | BASIC | -4,89 | □□□□□ -3,19 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25484-201 | ENSMUST00000178217 | 107 nt | BASIC | -4,89 | □□□□□ -3,19 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm26138-201 | ENSMUST00000179236 | 107 nt | BASIC | -4,89 | □□□□□ -3,19 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22821-201 | ENSMUST00000179288 | 107 nt | BASIC | -4,89 | □□□□□ -3,19 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm23298-201 | ENSMUST00000083181 | 107 nt | BASIC | -4,89 | □□□□□ -3,19 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25516-201 | ENSMUST00000083857 | 107 nt | BASIC | -4,89 | □□□□□ -3,19 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22213-201 | ENSMUST00000157564 | 119 nt | BASIC | -4,92 | □□□□□ -3,2 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm10563-201 | ENSMUST00000115821 | 237 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | -4,93 | □□□□□ -3,2 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22095-201 | ENSMUST00000158984 | 150 nt | BASIC | -4,94 | □□□□□ -3,2 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm23649-201 | ENSMUST00000179007 | 107 nt | BASIC | -4,95 | □□□□□ -3,2 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Snord58b-201 | ENSMUST00000082937 | 66 nt | BASIC | -4,96 | □□□□□ -3,2 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm23644-201 | ENSMUST00000157856 | 77 nt | BASIC | -4,97 | □□□□□ -3,21 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir1950-201 | ENSMUST00000158526 | 74 nt | BASIC | -4,97 | □□□□□ -3,21 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24234-201 | ENSMUST00000104316 | 107 nt | BASIC | -4,99 | □□□□□ -3,21 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir125b-1-201 | ENSMUST00000175613 | 77 nt | BASIC | -4,99 | □□□□□ -3,21 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22879-201 | ENSMUST00000082895 | 74 nt | BASIC | -4,99 | □□□□□ -3,21 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22056-201 | ENSMUST00000083386 | 81 nt | BASIC | -4,99 | □□□□□ -3,21 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24651-201 | ENSMUST00000157107 | 107 nt | BASIC | -5 | □□□□□ -3,21 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22925-201 | ENSMUST00000174956 | 102 nt | BASIC | -5,01 | □□□□□ -3,21 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25183-201 | ENSMUST00000157752 | 106 nt | BASIC | -5,04 | □□□□□ -3,22 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm23966-201 | ENSMUST00000179823 | 107 nt | BASIC | -5,06 | □□□□□ -3,22 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm27671-201 | ENSMUST00000183739 | 66 nt | BASIC | -5,06 | □□□□□ -3,22 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24167-201 | ENSMUST00000177733 | 124 nt | BASIC | -5,08 | □□□□□ -3,22 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22260-201 | ENSMUST00000178643 | 107 nt | BASIC | -5,08 | □□□□□ -3,22 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24028-201 | ENSMUST00000178991 | 124 nt | BASIC | -5,08 | □□□□□ -3,22 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir1955-201 | ENSMUST00000158014 | 98 nt | BASIC | -5,09 | □□□□□ -3,22 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm23350-201 | ENSMUST00000158429 | 103 nt | BASIC | -5,1 | □□□□□ -3,23 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm23578-201 | ENSMUST00000103943 | 104 nt | BASIC | -5,11 | □□□□□ -3,23 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22195-201 | ENSMUST00000116861 | 108 nt | BASIC | -5,14 | □□□□□ -3,23 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm27450-201 | ENSMUST00000104632 | 90 nt | BASIC | -5,15 | □□□□□ -3,23 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24387-201 | ENSMUST00000104625 | 90 nt | BASIC | -5,17 | □□□□□ -3,24 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24226-201 | ENSMUST00000158826 | 97 nt | BASIC | -5,17 | □□□□□ -3,24 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm26306-201 | ENSMUST00000157773 | 119 nt | BASIC | -5,23 | □□□□□ -3,25 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir1187-201 | ENSMUST00000116936 | 122 nt | BASIC | -5,27 | □□□□□ -3,25 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm26485-201 | ENSMUST00000158019 | 64 nt | BASIC | -5,27 | □□□□□ -3,25 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25222-201 | ENSMUST00000158199 | 126 nt | BASIC | -5,29 | □□□□□ -3,26 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | AC157278.1-201 | ENSMUST00000221621 | 148 nt | BASIC | -5,29 | □□□□□ -3,26 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm26139-201 | ENSMUST00000180098 | 107 nt | BASIC | -5,31 | □□□□□ -3,26 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | n-R5s214-201 | ENSMUST00000122494 | 121 nt | BASIC | -5,33 | □□□□□ -3,26 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir7116-201 | ENSMUST00000195956 | 70 nt | BASIC | -5,34 | □□□□□ -3,26 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir450b-201 | ENSMUST00000102095 | 82 nt | BASIC | -5,36 | □□□□□ -3,27 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24605-201 | ENSMUST00000104772 | 96 nt | BASIC | -5,37 | □□□□□ -3,27 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm11966-201 | ENSMUST00000119907 | 87 nt | BASIC | -5,38 | □□□□□ -3,27 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22845-201 | ENSMUST00000157712 | 104 nt | BASIC | -5,43 | □□□□□ -3,28 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22039-201 | ENSMUST00000157278 | 132 nt | BASIC | -5,46 | □□□□□ -3,28 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir669a-3-201 | ENSMUST00000102074 | 109 nt | BASIC | -5,48 | □□□□□ -3,29 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25987-201 | ENSMUST00000083234 | 107 nt | BASIC | -5,48 | □□□□□ -3,29 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir297a-2-201 | ENSMUST00000103795 | 90 nt | BASIC | -5,51 | □□□□□ -3,29 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm23652-201 | ENSMUST00000116752 | 107 nt | BASIC | -5,52 | □□□□□ -3,29 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm26227-201 | ENSMUST00000082510 | 101 nt | BASIC | -5,53 | □□□□□ -3,29 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25254-201 | ENSMUST00000157239 | 104 nt | BASIC | -5,54 | □□□□□ -3,3 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24710-201 | ENSMUST00000175235 | 101 nt | BASIC | -5,54 | □□□□□ -3,3 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24135-201 | ENSMUST00000179085 | 101 nt | BASIC | -5,54 | □□□□□ -3,3 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir7681-201 | ENSMUST00000184834 | 72 nt | BASIC | -5,54 | □□□□□ -3,3 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24148-201 | ENSMUST00000082762 | 80 nt | BASIC | -5,55 | □□□□□ -3,3 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22251-201 | ENSMUST00000083216 | 107 nt | BASIC | -5,56 | □□□□□ -3,3 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Snord50a-201 | ENSMUST00000178154 | 72 nt | BASIC | -5,59 | □□□□□ -3,3 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24463-201 | ENSMUST00000178417 | 72 nt | BASIC | -5,59 | □□□□□ -3,3 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25465-201 | ENSMUST00000157716 | 105 nt | BASIC | -5,6 | □□□□□ -3,31 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm23785-201 | ENSMUST00000116741 | 96 nt | BASIC | -5,61 | □□□□□ -3,31 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm23678-201 | ENSMUST00000083157 | 107 nt | BASIC | -5,62 | □□□□□ -3,31 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm20734-201 | ENSMUST00000216939 | 193 nt | BASIC | -5,66 | □□□□□ -3,32 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25815-201 | ENSMUST00000082755 | 107 nt | BASIC | -5,69 | □□□□□ -3,32 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm23038-201 | ENSMUST00000083873 | 104 nt | BASIC | -5,71 | □□□□□ -3,32 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22474-201 | ENSMUST00000179407 | 107 nt | BASIC | -5,72 | □□□□□ -3,33 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm23293-201 | ENSMUST00000082552 | 104 nt | BASIC | -5,72 | □□□□□ -3,33 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm44353-201 | ENSMUST00000200618 | 138 nt | BASIC | -5,75 | □□□□□ -3,33 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25521-201 | ENSMUST00000158393 | 108 nt | BASIC | -5,76 | □□□□□ -3,33 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24410-201 | ENSMUST00000083433 | 107 nt | BASIC | -5,77 | □□□□□ -3,33 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm24590-201 | ENSMUST00000116699 | 119 nt | BASIC | -5,78 | □□□□□ -3,33 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22078-201 | ENSMUST00000157593 | 103 nt | BASIC | -5,8 | □□□□□ -3,34 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25039-201 | ENSMUST00000082933 | 107 nt | BASIC | -5,85 | □□□□□ -3,35 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25382-201 | ENSMUST00000157811 | 97 nt | BASIC | -5,86 | □□□□□ -3,35 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm44303-201 | ENSMUST00000196348 | 83 nt | BASIC | -5,87 | □□□□□ -3,35 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22950-201 | ENSMUST00000082776 | 107 nt | BASIC | -5,9 | □□□□□ -3,35 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm23961-201 | ENSMUST00000104685 | 97 nt | BASIC | -5,91 | □□□□□ -3,36 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | mt-Tl2-201 | ENSMUST00000082417 | 71 nt | BASIC | -5,97 | □□□□□ -3,37 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | AL929417.1-201 | ENSMUST00000214901 | 124 nt | BASIC | -5,98 | □□□□□ -3,37 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22550-201 | ENSMUST00000179774 | 107 nt | BASIC | -6,02 | □□□□□ -3,37 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22060-201 | ENSMUST00000082558 | 107 nt | BASIC | -6,02 | □□□□□ -3,37 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22381-201 | ENSMUST00000158186 | 107 nt | BASIC | -6,04 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22301-201 | ENSMUST00000082656 | 107 nt | BASIC | -6,05 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm25022-201 | ENSMUST00000102205 | 83 nt | BASIC | -6,08 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir467a-6-201 | ENSMUST00000177790 | 83 nt | BASIC | -6,08 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir467a-3-201 | ENSMUST00000178082 | 83 nt | BASIC | -6,08 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir467a-7-201 | ENSMUST00000178635 | 83 nt | BASIC | -6,08 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir467a-10-201 | ENSMUST00000179320 | 83 nt | BASIC | -6,08 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir467a-5-201 | ENSMUST00000179352 | 83 nt | BASIC | -6,08 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir467a-2-201 | ENSMUST00000179447 | 83 nt | BASIC | -6,08 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir467a-9-201 | ENSMUST00000179752 | 83 nt | BASIC | -6,08 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir467a-4-201 | ENSMUST00000179923 | 83 nt | BASIC | -6,08 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir467a-8-201 | ENSMUST00000180070 | 83 nt | BASIC | -6,08 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Mir669m-2-201 | ENSMUST00000158355 | 98 nt | BASIC | -6,09 | □□□□□ -3,38 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Traj42-201 | ENSMUST00000103700 | 64 nt | APPRIS P1 BASIC | -6,12 | □□□□□ -3,39 | | |
Chmp4b | Q9D8B3 | Gm22679-201 | ENSMUST00000116975 | 100 nt | BASIC | -6,16 | □□□□□ -3,4 | | |
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