Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm26139-201ENSMUST00000180098 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm11966-201ENSMUST00000119907 87 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
NischQ80TM9 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
NischQ80TM9 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
NischQ80TM9 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
NischQ80TM9 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
NischQ80TM9 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
NischQ80TM9 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
NischQ80TM9 Gm25465-201ENSMUST00000157716 105 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
NischQ80TM9 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
NischQ80TM9 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
NischQ80TM9 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
NischQ80TM9 Gm24710-201ENSMUST00000175235 101 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
NischQ80TM9 Gm24135-201ENSMUST00000179085 101 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
NischQ80TM9 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
NischQ80TM9 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
NischQ80TM9 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
NischQ80TM9 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
NischQ80TM9 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
NischQ80TM9 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
NischQ80TM9 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
NischQ80TM9 Gm23785-201ENSMUST00000116741 96 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
NischQ80TM9 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
NischQ80TM9 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
NischQ80TM9 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
NischQ80TM9 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
NischQ80TM9 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
NischQ80TM9 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
NischQ80TM9 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
NischQ80TM9 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
NischQ80TM9 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
NischQ80TM9 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
NischQ80TM9 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.02
NischQ80TM9 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
NischQ80TM9 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
NischQ80TM9 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
NischQ80TM9 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
NischQ80TM9 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
NischQ80TM9 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
NischQ80TM9 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
NischQ80TM9 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
NischQ80TM9 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
NischQ80TM9 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
NischQ80TM9 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NischQ80TM9 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NischQ80TM9 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
NischQ80TM9 Gm26227-201ENSMUST00000082510 101 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
NischQ80TM9 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
NischQ80TM9 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
NischQ80TM9 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
NischQ80TM9 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
NischQ80TM9 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
NischQ80TM9 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
NischQ80TM9 Gm22127-201ENSMUST00000083239 106 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
NischQ80TM9 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
NischQ80TM9 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
NischQ80TM9 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC-4.21□□□□□ -3.08
NischQ80TM9 Gm23961-201ENSMUST00000104685 97 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
NischQ80TM9 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-4.21□□□□□ -3.08
NischQ80TM9 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
NischQ80TM9 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
NischQ80TM9 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
NischQ80TM9 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
NischQ80TM9 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
NischQ80TM9 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
NischQ80TM9 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
NischQ80TM9 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
NischQ80TM9 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
NischQ80TM9 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
NischQ80TM9 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
NischQ80TM9 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms