Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
NipblQ6KCD5 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
NipblQ6KCD5 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
NipblQ6KCD5 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
NipblQ6KCD5 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
NipblQ6KCD5 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
NipblQ6KCD5 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
NipblQ6KCD5 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
NipblQ6KCD5 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
NipblQ6KCD5 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
NipblQ6KCD5 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3.86□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-3.86□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
NipblQ6KCD5 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
NipblQ6KCD5 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
NipblQ6KCD5 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
NipblQ6KCD5 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
NipblQ6KCD5 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
NipblQ6KCD5 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
NipblQ6KCD5 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
NipblQ6KCD5 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC-3.98□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC-3.99□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
NipblQ6KCD5 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
NipblQ6KCD5 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
NipblQ6KCD5 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
NipblQ6KCD5 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
NipblQ6KCD5 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
NipblQ6KCD5 Gm22593-201ENSMUST00000104245 109 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
NipblQ6KCD5 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
NipblQ6KCD5 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
NipblQ6KCD5 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-4.17□□□□□ -3.08
NipblQ6KCD5 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
NipblQ6KCD5 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
NipblQ6KCD5 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
NipblQ6KCD5 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
NipblQ6KCD5 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
NipblQ6KCD5 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
NipblQ6KCD5 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
NipblQ6KCD5 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
NipblQ6KCD5 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
NipblQ6KCD5 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
NipblQ6KCD5 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC-4.29□□□□□ -3.1
NipblQ6KCD5 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
NipblQ6KCD5 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
NipblQ6KCD5 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
NipblQ6KCD5 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
NipblQ6KCD5 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
NipblQ6KCD5 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
NipblQ6KCD5 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
NipblQ6KCD5 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
NipblQ6KCD5 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
NipblQ6KCD5 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
NipblQ6KCD5 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
NipblQ6KCD5 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
NipblQ6KCD5 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
NipblQ6KCD5 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
NipblQ6KCD5 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-4.44□□□□□ -3.12
NipblQ6KCD5 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
NipblQ6KCD5 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
NipblQ6KCD5 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
NipblQ6KCD5 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
NipblQ6KCD5 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
NipblQ6KCD5 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
NipblQ6KCD5 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
NipblQ6KCD5 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
NipblQ6KCD5 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
NipblQ6KCD5 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
NipblQ6KCD5 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
NipblQ6KCD5 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
NipblQ6KCD5 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
NipblQ6KCD5 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
NipblQ6KCD5 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
NipblQ6KCD5 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
NipblQ6KCD5 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC-4.69□□□□□ -3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.8 ms