Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I8

Trav3-1, T cell receptor alpha variable 3-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-1Q5R1I8 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC-5,2□□□□□ -3,24
Trav3-1Q5R1I8 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC-5,22□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC-5,22□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC-5,23□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-5,23□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC-5,24□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC-5,24□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC-5,24□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC-5,24□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC-5,24□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC-5,24□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC-5,24□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC-5,26□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC-5,26□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC-5,28□□□□□ -3,25
Trav3-1Q5R1I8 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC-5,31□□□□□ -3,26
Trav3-1Q5R1I8 Gm26227-201ENSMUST00000082510 101 ntBASIC-5,31□□□□□ -3,26
Trav3-1Q5R1I8 Gm23785-201ENSMUST00000116741 96 ntBASIC-5,33□□□□□ -3,26
Trav3-1Q5R1I8 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC-5,34□□□□□ -3,26
Trav3-1Q5R1I8 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC-5,36□□□□□ -3,27
Trav3-1Q5R1I8 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC-5,36□□□□□ -3,27
Trav3-1Q5R1I8 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC-5,36□□□□□ -3,27
Trav3-1Q5R1I8 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC-5,36□□□□□ -3,27
Trav3-1Q5R1I8 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC-5,36□□□□□ -3,27
Trav3-1Q5R1I8 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC-5,36□□□□□ -3,27
Trav3-1Q5R1I8 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC-5,36□□□□□ -3,27
Trav3-1Q5R1I8 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC-5,37□□□□□ -3,27
Trav3-1Q5R1I8 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC-5,41□□□□□ -3,28
Trav3-1Q5R1I8 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC-5,41□□□□□ -3,28
Trav3-1Q5R1I8 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC-5,45□□□□□ -3,28
Trav3-1Q5R1I8 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC-5,47□□□□□ -3,29
Trav3-1Q5R1I8 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC-5,47□□□□□ -3,29
Trav3-1Q5R1I8 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-5,47□□□□□ -3,29
Trav3-1Q5R1I8 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC-5,49□□□□□ -3,29
Trav3-1Q5R1I8 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC-5,49□□□□□ -3,29
Trav3-1Q5R1I8 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC-5,54□□□□□ -3,3
Trav3-1Q5R1I8 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC-5,58□□□□□ -3,3
Trav3-1Q5R1I8 Gm23961-201ENSMUST00000104685 97 ntBASIC-5,6□□□□□ -3,31
Trav3-1Q5R1I8 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC-5,6□□□□□ -3,31
Trav3-1Q5R1I8 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC-5,61□□□□□ -3,31
Trav3-1Q5R1I8 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC-5,63□□□□□ -3,31
Trav3-1Q5R1I8 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC-5,64□□□□□ -3,31
Trav3-1Q5R1I8 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC-5,64□□□□□ -3,31
Trav3-1Q5R1I8 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC-5,66□□□□□ -3,32
Trav3-1Q5R1I8 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC-5,67□□□□□ -3,32
Trav3-1Q5R1I8 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC-5,67□□□□□ -3,32
Trav3-1Q5R1I8 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC-5,69□□□□□ -3,32
Trav3-1Q5R1I8 Gm22127-201ENSMUST00000083239 106 ntBASIC-5,7□□□□□ -3,32
Trav3-1Q5R1I8 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-5,71□□□□□ -3,32
Trav3-1Q5R1I8 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC-5,73□□□□□ -3,33
Trav3-1Q5R1I8 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC-5,73□□□□□ -3,33
Trav3-1Q5R1I8 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC-5,74□□□□□ -3,33
Trav3-1Q5R1I8 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC-5,74□□□□□ -3,33
Trav3-1Q5R1I8 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC-5,74□□□□□ -3,33
Trav3-1Q5R1I8 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC-5,75□□□□□ -3,33
Trav3-1Q5R1I8 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC-5,75□□□□□ -3,33
Trav3-1Q5R1I8 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC-5,76□□□□□ -3,33
Trav3-1Q5R1I8 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC-5,77□□□□□ -3,33
Trav3-1Q5R1I8 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC-5,79□□□□□ -3,34
Trav3-1Q5R1I8 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC-5,8□□□□□ -3,34
Trav3-1Q5R1I8 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC-5,82□□□□□ -3,34
Trav3-1Q5R1I8 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC-5,86□□□□□ -3,35
Trav3-1Q5R1I8 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-5,86□□□□□ -3,35
Trav3-1Q5R1I8 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC-5,89□□□□□ -3,35
Trav3-1Q5R1I8 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC-5,89□□□□□ -3,35
Trav3-1Q5R1I8 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC-5,9□□□□□ -3,35
Trav3-1Q5R1I8 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC-5,91□□□□□ -3,36
Trav3-1Q5R1I8 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC-5,91□□□□□ -3,36
Trav3-1Q5R1I8 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC-5,92□□□□□ -3,36
Trav3-1Q5R1I8 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC-5,93□□□□□ -3,36
Trav3-1Q5R1I8 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC-5,97□□□□□ -3,37
Trav3-1Q5R1I8 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC-5,99□□□□□ -3,37
Trav3-1Q5R1I8 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC-6,01□□□□□ -3,37
Trav3-1Q5R1I8 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC-6,02□□□□□ -3,37
Trav3-1Q5R1I8 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC-6,03□□□□□ -3,37
Trav3-1Q5R1I8 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC-6,04□□□□□ -3,38
Trav3-1Q5R1I8 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC-6,07□□□□□ -3,38
Trav3-1Q5R1I8 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC-6,1□□□□□ -3,39
Trav3-1Q5R1I8 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC-6,15□□□□□ -3,39
Trav3-1Q5R1I8 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC-6,19□□□□□ -3,4
Trav3-1Q5R1I8 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC-6,22□□□□□ -3,41
Trav3-1Q5R1I8 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC-6,24□□□□□ -3,41
Trav3-1Q5R1I8 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC-6,24□□□□□ -3,41
Trav3-1Q5R1I8 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC-6,24□□□□□ -3,41
Trav3-1Q5R1I8 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC-6,24□□□□□ -3,41
Trav3-1Q5R1I8 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC-6,24□□□□□ -3,41
Trav3-1Q5R1I8 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC-6,24□□□□□ -3,41
Trav3-1Q5R1I8 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC-6,24□□□□□ -3,41
Trav3-1Q5R1I8 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC-6,24□□□□□ -3,41
Trav3-1Q5R1I8 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC-6,24□□□□□ -3,41
Trav3-1Q5R1I8 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC-6,24□□□□□ -3,41
Trav3-1Q5R1I8 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC-6,25□□□□□ -3,41
Trav3-1Q5R1I8 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC-6,29□□□□□ -3,42
Trav3-1Q5R1I8 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC-6,3□□□□□ -3,42
Trav3-1Q5R1I8 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC-6,31□□□□□ -3,42
Trav3-1Q5R1I8 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC-6,33□□□□□ -3,42
Trav3-1Q5R1I8 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC-6,34□□□□□ -3,42
Trav3-1Q5R1I8 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC-6,37□□□□□ -3,43
Trav3-1Q5R1I8 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC-6,4□□□□□ -3,43
Trav3-1Q5R1I8 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC-6,44□□□□□ -3,44
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