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Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1
Atmin, ATM interactor, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Atmin
Q6P9S1
Mir192-201
ENSMUST00000083589
89 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
Atmin
Q6P9S1
Scarna8-201
ENSMUST00000158333
131 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
Atmin
Q6P9S1
Gm6358-201
ENSMUST00000089101
156 nt
APPRIS ALT2
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
Atmin
Q6P9S1
Gm24336-201
ENSMUST00000104203
146 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
Atmin
Q6P9S1
Gm22313-201
ENSMUST00000158008
129 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
Atmin
Q6P9S1
Gm27475-201
ENSMUST00000183420
61 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
Atmin
Q6P9S1
Mir7094-2-201
ENSMUST00000184622
60 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
Atmin
Q6P9S1
Mir7094-1-201
ENSMUST00000199671
60 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
Atmin
Q6P9S1
Gm23531-201
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68 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
Atmin
Q6P9S1
Gm22759-201
ENSMUST00000102276
96 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
Atmin
Q6P9S1
Gm25885-201
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109 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
Atmin
Q6P9S1
Gm24455-201
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131 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
Atmin
Q6P9S1
Gm25429-201
ENSMUST00000157607
132 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
Atmin
Q6P9S1
Gm44589-201
ENSMUST00000207025
115 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
Atmin
Q6P9S1
Mir29b-1-201
ENSMUST00000083670
71 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
Atmin
Q6P9S1
Gm24003-201
ENSMUST00000158455
100 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Gm26116-201
ENSMUST00000175600
77 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Mir710-201
ENSMUST00000102088
110 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Gm22327-201
ENSMUST00000158899
108 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Mir1839-201
ENSMUST00000175366
127 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Mir136-201
ENSMUST00000199494
62 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
AC167019.1-201
ENSMUST00000227913
106 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
n-R5s171-201
ENSMUST00000104128
79 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Gm24833-201
ENSMUST00000116775
120 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Gm25712-201
ENSMUST00000158634
93 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Gm26124-201
ENSMUST00000083359
108 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Snord16a-201
ENSMUST00000083895
99 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Gm26262-201
ENSMUST00000158024
127 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Gm44375-201
ENSMUST00000196657
150 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
AC122210.2-201
ENSMUST00000220216
115 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Mir672-201
ENSMUST00000102331
100 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
n-R5s18-201
ENSMUST00000122740
121 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Gm26152-201
ENSMUST00000157427
101 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Gm25601-201
ENSMUST00000158356
105 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Mir8107-201
ENSMUST00000184024
117 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Gm26210-201
ENSMUST00000158680
91 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
Atmin
Q6P9S1
Gm22573-201
ENSMUST00000082982
102 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Atmin
Q6P9S1
Gm24051-201
ENSMUST00000158622
75 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
Atmin
Q6P9S1
Gm25521-201
ENSMUST00000158393
108 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
Atmin
Q6P9S1
Gm25472-201
ENSMUST00000175454
78 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
Atmin
Q6P9S1
Gm23556-201
ENSMUST00000157821
92 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
Atmin
Q6P9S1
Gm24775-201
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99 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
Atmin
Q6P9S1
Snord85-201
ENSMUST00000083262
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BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
Atmin
Q6P9S1
Mir1969-201
ENSMUST00000157623
94 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
Atmin
Q6P9S1
Gm22013-201
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103 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
Atmin
Q6P9S1
Gm44328-201
ENSMUST00000199331
75 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
Atmin
Q6P9S1
Gm19248-201
ENSMUST00000209404
110 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
Atmin
Q6P9S1
Gm24714-201
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101 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Gm24793-201
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132 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Gm25952-201
ENSMUST00000175329
74 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Gm23166-201
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101 nt
BASIC
0.2
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Gm25249-201
ENSMUST00000175471
78 nt
BASIC
0.2
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Gm11116-201
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54 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Mir141-201
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72 nt
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Gm25225-201
ENSMUST00000158197
102 nt
BASIC
0.18
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Snord123-201
ENSMUST00000158692
71 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Gm23308-201
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107 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Gm23749-201
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131 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Gm22077-201
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93 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Mir3089-201
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84 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
mt-Ts1-201
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BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Gm25137-201
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110 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Atmin
Q6P9S1
Gm23314-201
ENSMUST00000157218
107 nt
BASIC
0.15
□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Gm26043-201
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91 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Gm24903-201
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126 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Gm25867-201
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103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Gm23428-201
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102 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Mir124a-1-201
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85 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Traj35-201
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65 nt
APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Mir493-201
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BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Mir7038-201
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71 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Gm22324-201
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114 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Gm25596-201
ENSMUST00000178368
107 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Mir677-202
ENSMUST00000197076
78 nt
BASIC
0.1
□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Mir96-201
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106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
Atmin
Q6P9S1
Gm22368-201
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BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Mir3470a-201
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77 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Mir382-201
ENSMUST00000083494
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BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm25493-201
ENSMUST00000157375
103 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Mir6915-201
ENSMUST00000198839
69 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm22813-201
ENSMUST00000199948
123 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Mir379-201
ENSMUST00000083564
66 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm23216-201
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107 nt
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Mir6904-201
ENSMUST00000183443
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BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Mir378c-201
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99 nt
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm17522-202
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174 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm17412-202
ENSMUST00000189566
174 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm25338-201
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120 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm24381-201
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104 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm25032-201
ENSMUST00000175411
84 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
n-R5s42-201
ENSMUST00000082697
104 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm22296-201
ENSMUST00000083310
103 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
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BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
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BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm25703-201
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151 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm22962-201
ENSMUST00000157962
73 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm43943-201
ENSMUST00000204201
113 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm23248-201
ENSMUST00000083367
108 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Atmin
Q6P9S1
Gm45374-201
ENSMUST00000211388
136 nt
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Atmin
Q6P9S1
Gm26395-201
ENSMUST00000104094
132 nt
BASIC
0.01
□□□□□ -2.41
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