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Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9
Bfsp2, Phakinin, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24485-201
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BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Gm29344-201
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210 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Gm23293-201
ENSMUST00000082552
104 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Gm26257-201
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107 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Mir181b-1-201
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80 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Snord123-201
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71 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Mir6339-201
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BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Mir6964-201
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59 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Gm23974-201
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BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
n-R5s153-201
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BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Gm25862-201
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BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24051-201
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BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Gm25087-201
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-1.09
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Gm22013-201
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BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Gm26467-201
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BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
Bfsp2
Q6NVD9
Mir543-201
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BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
Gm26043-201
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BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
AC238676.2-201
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BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24091-201
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BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
Gm23711-201
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BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
Gm22197-201
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BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
Gm26485-201
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64 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
Gm22016-201
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114 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24612-201
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BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
Gm25429-201
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BASIC
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□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
Gm25648-201
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BASIC
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□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
AC161271.1-201
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150 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
Mir466l-201
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121 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
Bfsp2
Q6NVD9
Snord8-201
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110 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Gm27944-201
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103 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Gm11966-201
ENSMUST00000119907
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BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Mir466m-201
ENSMUST00000175052
84 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Gm26124-201
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108 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Traj42-201
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BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Gm23812-201
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BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Gm23374-201
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84 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Gm25493-201
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103 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Gm25326-201
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107 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Mir1969-201
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BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24554-201
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BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24197-201
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BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Gm23649-201
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BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24775-201
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BASIC
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□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Mirlet7a-2-201
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BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
Gm25652-201
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BASIC
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□□□□□ -2.6
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Bfsp2
Q6NVD9
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□□□□□ -2.61
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
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□□□□□ -2.61
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Bfsp2
Q6NVD9
Gm22965-201
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BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Bfsp2
Q6NVD9
mt-Tl2-201
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BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Bfsp2
Q6NVD9
Gm23730-201
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107 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Bfsp2
Q6NVD9
Gm22746-201
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107 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
Bfsp2
Q6NVD9
Gm22430-201
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BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
Gm25626-201
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107 nt
BASIC
-1.29
□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
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Bfsp2
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TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
Gm17412-202
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174 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
Mir34c-201
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
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Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
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Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
Gm23108-201
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BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
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Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
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□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24927-201
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BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
Gm10663-201
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66 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24996-201
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99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.63
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Bfsp2
Q6NVD9
Gm27450-201
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BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24226-201
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BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
Bfsp2
Q6NVD9
Gm25903-201
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103 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Bfsp2
Q6NVD9
Gm25601-201
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105 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24459-201
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86 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
Bfsp2
Q6NVD9
Gm22464-201
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BASIC
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□□□□□ -2.63
Bfsp2
Q6NVD9
Gm25847-201
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BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24797-201
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BASIC
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□□□□□ -2.64
Bfsp2
Q6NVD9
Gm44347-201
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108 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
Bfsp2
Q6NVD9
Gm22602-201
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95 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24723-201
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132 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
Bfsp2
Q6NVD9
Mir7086-201
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65 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
Bfsp2
Q6NVD9
Mir122-201
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BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Bfsp2
Q6NVD9
Gm25023-201
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107 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
Bfsp2
Q6NVD9
Gm26139-201
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107 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
-1.46
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Bfsp2
Q6NVD9
Gm23811-201
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84 nt
BASIC
-1.47
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Bfsp2
Q6NVD9
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BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
Bfsp2
Q6NVD9
Gm24725-201
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125 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
Bfsp2
Q6NVD9
Gm23992-201
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67 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
Bfsp2
Q6NVD9
Gm27645-201
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77 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
Bfsp2
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BASIC
-1.49
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Bfsp2
Q6NVD9
Gm24097-201
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107 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
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