Protein–RNA interactions for Protein: Q61191
Hcfc1, Host cell factor 1, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23607-201 | ENSMUST00000104550 | 126 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24612-201 | ENSMUST00000083267 | 107 nt | BASIC | -0,64 | □□□□□ -2,51 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25326-201 | ENSMUST00000101903 | 107 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22965-201 | ENSMUST00000157958 | 101 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Hcfc1 | Q61191 | mt-Tl2-201 | ENSMUST00000082417 | 71 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22305-201 | ENSMUST00000082690 | 108 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25158-201 | ENSMUST00000177681 | 121 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm26229-201 | ENSMUST00000179699 | 121 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22746-201 | ENSMUST00000082494 | 107 nt | BASIC | -0,65 | □□□□□ -2,51 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22540-201 | ENSMUST00000158168 | 117 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22039-201 | ENSMUST00000157278 | 132 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir1839-201 | ENSMUST00000175366 | 127 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm26233-201 | ENSMUST00000175530 | 70 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24927-201 | ENSMUST00000083397 | 107 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22078-201 | ENSMUST00000157593 | 103 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24797-201 | ENSMUST00000178103 | 107 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24259-201 | ENSMUST00000083740 | 107 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm27450-201 | ENSMUST00000104632 | 90 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24723-201 | ENSMUST00000158233 | 132 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23826-201 | ENSMUST00000157394 | 119 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir181b-1-201 | ENSMUST00000083524 | 80 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm26262-201 | ENSMUST00000158024 | 127 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22357-201 | ENSMUST00000082882 | 83 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22938-201 | ENSMUST00000103956 | 120 nt | BASIC | -0,71 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22069-201 | ENSMUST00000179911 | 107 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm44311-201 | ENSMUST00000196448 | 69 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22813-202 | ENSMUST00000200346 | 124 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25847-201 | ENSMUST00000116793 | 96 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mirlet7b-201 | ENSMUST00000083630 | 85 nt | BASIC | -0,74 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir302c-201 | ENSMUST00000083548 | 68 nt | BASIC | -0,74 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24459-201 | ENSMUST00000082730 | 86 nt | BASIC | -0,75 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23730-201 | ENSMUST00000083236 | 107 nt | BASIC | -0,75 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24297-201 | ENSMUST00000158300 | 68 nt | BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm37646-201 | ENSMUST00000191756 | 111 nt | BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm26131-201 | ENSMUST00000082725 | 110 nt | BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir29b-1-201 | ENSMUST00000083670 | 71 nt | BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25903-201 | ENSMUST00000158492 | 103 nt | BASIC | -0,77 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25652-201 | ENSMUST00000083780 | 103 nt | BASIC | -0,77 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | AC161271.1-201 | ENSMUST00000226914 | 150 nt | BASIC | -0,77 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23573-201 | ENSMUST00000104408 | 107 nt | BASIC | -0,78 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24108-201 | ENSMUST00000175495 | 77 nt | BASIC | -0,78 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir6957-201 | ENSMUST00000183708 | 64 nt | BASIC | -0,78 | □□□□□ -2,53 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24003-201 | ENSMUST00000158455 | 100 nt | BASIC | -0,79 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24226-201 | ENSMUST00000158826 | 97 nt | BASIC | -0,79 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir6339-201 | ENSMUST00000185120 | 117 nt | BASIC | -0,79 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | mt-Ts1-201 | ENSMUST00000082403 | 69 nt | BASIC | -0,79 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24197-201 | ENSMUST00000175085 | 109 nt | BASIC | -0,79 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir6961-201 | ENSMUST00000183874 | 67 nt | BASIC | -0,79 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25045-201 | ENSMUST00000122670 | 99 nt | BASIC | -0,8 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23613-201 | ENSMUST00000082596 | 87 nt | BASIC | -0,8 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm27944-201 | ENSMUST00000185155 | 103 nt | BASIC | -0,81 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm17522-202 | ENSMUST00000186631 | 174 nt | TSL 1 (best) BASIC | -0,81 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm17412-202 | ENSMUST00000189566 | 174 nt | TSL 1 (best) BASIC | -0,81 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | n-R5s153-201 | ENSMUST00000083451 | 116 nt | BASIC | -0,82 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22446-201 | ENSMUST00000180108 | 104 nt | BASIC | -0,83 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23904-201 | ENSMUST00000157567 | 124 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir1969-201 | ENSMUST00000157623 | 94 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir7055-201 | ENSMUST00000197423 | 59 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm26124-201 | ENSMUST00000083359 | 108 nt | BASIC | -0,84 | □□□□□ -2,54 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25429-201 | ENSMUST00000157607 | 132 nt | BASIC | -0,85 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24704-201 | ENSMUST00000093715 | 107 nt | BASIC | -0,85 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24714-201 | ENSMUST00000102382 | 101 nt | BASIC | -0,86 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23831-201 | ENSMUST00000158895 | 85 nt | BASIC | -0,86 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23992-201 | ENSMUST00000174981 | 67 nt | BASIC | -0,86 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir466q-201 | ENSMUST00000175249 | 76 nt | BASIC | -0,86 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Snord16a-201 | ENSMUST00000083895 | 99 nt | BASIC | -0,86 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25465-201 | ENSMUST00000157716 | 105 nt | BASIC | -0,86 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm26139-201 | ENSMUST00000180098 | 107 nt | BASIC | -0,87 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22943-201 | ENSMUST00000158564 | 76 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23237-201 | ENSMUST00000104639 | 92 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25862-201 | ENSMUST00000158250 | 129 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir7015-201 | ENSMUST00000199525 | 64 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23974-201 | ENSMUST00000083321 | 131 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23166-201 | ENSMUST00000157164 | 101 nt | BASIC | -0,89 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm27935-201 | ENSMUST00000183894 | 79 nt | BASIC | -0,89 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23630-201 | ENSMUST00000175292 | 104 nt | BASIC | -0,9 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23335-201 | ENSMUST00000117021 | 90 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24725-201 | ENSMUST00000158229 | 125 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mirlet7a-2-201 | ENSMUST00000175029 | 96 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24097-201 | ENSMUST00000178720 | 107 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,55 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23199-201 | ENSMUST00000158812 | 107 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25995-201 | ENSMUST00000175396 | 142 nt | BASIC | -0,92 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23308-201 | ENSMUST00000179475 | 107 nt | BASIC | -0,92 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24051-201 | ENSMUST00000158622 | 75 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | AC122210.2-201 | ENSMUST00000220216 | 115 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24554-201 | ENSMUST00000158654 | 73 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22474-201 | ENSMUST00000179407 | 107 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24775-201 | ENSMUST00000157377 | 99 nt | BASIC | -0,95 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm43943-201 | ENSMUST00000204201 | 113 nt | BASIC | -0,95 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25493-201 | ENSMUST00000157375 | 103 nt | BASIC | -0,96 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Snord123-201 | ENSMUST00000158692 | 71 nt | BASIC | -0,96 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22197-201 | ENSMUST00000116866 | 58 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir7086-201 | ENSMUST00000183683 | 65 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25601-201 | ENSMUST00000158356 | 105 nt | BASIC | -0,98 | □□□□□ -2,57 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm23421-201 | ENSMUST00000158934 | 104 nt | BASIC | -0,99 | □□□□□ -2,57 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir297b-201 | ENSMUST00000102268 | 109 nt | BASIC | -0,99 | □□□□□ -2,57 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Mir7218-201 | ENSMUST00000200050 | 59 nt | BASIC | -0,99 | □□□□□ -2,57 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm25354-201 | ENSMUST00000179110 | 105 nt | BASIC | -1 | □□□□□ -2,57 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm22067-201 | ENSMUST00000122790 | 107 nt | BASIC | -1,01 | □□□□□ -2,57 | | |
Hcfc1 | Q61191 | Gm24396-201 | ENSMUST00000116905 | 93 nt | BASIC | -1,01 | □□□□□ -2,57 | | |
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