Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm25297-201ENSMUST00000175490 67 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
Sft2d1Q5SSN7 Mir351-201ENSMUST00000083569 99 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm26307-201ENSMUST00000157767 126 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Mir493-201ENSMUST00000103837 83 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
Sft2d1Q5SSN7 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm22879-201ENSMUST00000082895 74 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
Sft2d1Q5SSN7 Mir154-201ENSMUST00000083514 66 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
Sft2d1Q5SSN7 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-4.11□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm27882-201ENSMUST00000184904 74 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC-4.14□□□□□ -3.07
Sft2d1Q5SSN7 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm22401-201ENSMUST00000174927 117 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
Sft2d1Q5SSN7 Mir1906-1-201ENSMUST00000122586 80 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 Mir1906-2-201ENSMUST00000122610 80 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 Mir664-201ENSMUST00000196796 69 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 Mir124a-1-201ENSMUST00000083663 85 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm22056-201ENSMUST00000083386 81 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
Sft2d1Q5SSN7 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
Sft2d1Q5SSN7 Mir125b-1-201ENSMUST00000175613 77 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
Sft2d1Q5SSN7 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm26139-201ENSMUST00000180098 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
Sft2d1Q5SSN7 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-4.4□□□□□ -3.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
Sft2d1Q5SSN7 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms