Protein–RNA interactions for Protein: P16546
Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Sptan1 | P16546 | Gm24410-201 | ENSMUST00000083433 | 107 nt | BASIC | -4,36 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24378-201 | ENSMUST00000122699 | 106 nt | BASIC | -4,37 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24710-201 | ENSMUST00000175235 | 101 nt | BASIC | -4,37 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24135-201 | ENSMUST00000179085 | 101 nt | BASIC | -4,37 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Olfr1108-ps1-201 | ENSMUST00000216930 | 121 nt | BASIC | -4,37 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23790-201 | ENSMUST00000083013 | 107 nt | BASIC | -4,37 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Mir471-201 | ENSMUST00000093596 | 67 nt | BASIC | -4,37 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24737-201 | ENSMUST00000158861 | 100 nt | BASIC | -4,38 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24225-201 | ENSMUST00000158825 | 98 nt | BASIC | -4,38 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm25390-201 | ENSMUST00000157341 | 103 nt | BASIC | -4,39 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22078-201 | ENSMUST00000157593 | 103 nt | BASIC | -4,39 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm25482-201 | ENSMUST00000083225 | 107 nt | BASIC | -4,39 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm14838-201 | ENSMUST00000118913 | 248 nt | BASIC | -4,4 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24226-201 | ENSMUST00000158826 | 97 nt | BASIC | -4,4 | □□□□□ -3,11 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm26225-201 | ENSMUST00000082508 | 135 nt | BASIC | -4,41 | □□□□□ -3,12 | | |
Sptan1 | P16546 | CT010505.1-201 | ENSMUST00000227026 | 396 nt | BASIC | -4,42 | □□□□□ -3,12 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22301-201 | ENSMUST00000082656 | 107 nt | BASIC | -4,43 | □□□□□ -3,12 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24150-201 | ENSMUST00000082759 | 104 nt | BASIC | -4,43 | □□□□□ -3,12 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24194-201 | ENSMUST00000116805 | 90 nt | BASIC | -4,43 | □□□□□ -3,12 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm27987-201 | ENSMUST00000184023 | 93 nt | BASIC | -4,43 | □□□□□ -3,12 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22349-201 | ENSMUST00000157864 | 107 nt | BASIC | -4,44 | □□□□□ -3,12 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm26485-201 | ENSMUST00000158019 | 64 nt | BASIC | -4,44 | □□□□□ -3,12 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22095-201 | ENSMUST00000158984 | 150 nt | BASIC | -4,45 | □□□□□ -3,12 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23258-201 | ENSMUST00000158319 | 106 nt | BASIC | -4,46 | □□□□□ -3,12 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23376-201 | ENSMUST00000082938 | 160 nt | BASIC | -4,46 | □□□□□ -3,12 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm44395-201 | ENSMUST00000197056 | 153 nt | BASIC | -4,47 | □□□□□ -3,12 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24495-201 | ENSMUST00000178575 | 79 nt | BASIC | -4,49 | □□□□□ -3,13 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24674-201 | ENSMUST00000179194 | 104 nt | BASIC | -4,49 | □□□□□ -3,13 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22253-201 | ENSMUST00000179870 | 79 nt | BASIC | -4,49 | □□□□□ -3,13 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm10999-201 | ENSMUST00000108743 | 207 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | -4,5 | □□□□□ -3,13 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22490-201 | ENSMUST00000157188 | 119 nt | BASIC | -4,5 | □□□□□ -3,13 | | |
Sptan1 | P16546 | Mir3083-201 | ENSMUST00000175377 | 64 nt | BASIC | -4,5 | □□□□□ -3,13 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22550-201 | ENSMUST00000179774 | 107 nt | BASIC | -4,51 | □□□□□ -3,13 | | |
Sptan1 | P16546 | Mir7093-201 | ENSMUST00000184195 | 101 nt | BASIC | -4,51 | □□□□□ -3,13 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22060-201 | ENSMUST00000082558 | 107 nt | BASIC | -4,51 | □□□□□ -3,13 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm27694-201 | ENSMUST00000184740 | 86 nt | BASIC | -4,52 | □□□□□ -3,13 | | |
Sptan1 | P16546 | Mir466e-201 | ENSMUST00000198862 | 84 nt | BASIC | -4,53 | □□□□□ -3,13 | | |
Sptan1 | P16546 | Mir466c-1-201 | ENSMUST00000200654 | 84 nt | BASIC | -4,53 | □□□□□ -3,13 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22255-201 | ENSMUST00000177933 | 79 nt | BASIC | -4,53 | □□□□□ -3,14 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23254-201 | ENSMUST00000097244 | 79 nt | BASIC | -4,53 | □□□□□ -3,14 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23209-201 | ENSMUST00000158667 | 110 nt | BASIC | -4,55 | □□□□□ -3,14 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm26139-201 | ENSMUST00000180098 | 107 nt | BASIC | -4,55 | □□□□□ -3,14 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24211-201 | ENSMUST00000158264 | 107 nt | BASIC | -4,56 | □□□□□ -3,14 | | |
Sptan1 | P16546 | Mir181a-1-201 | ENSMUST00000083631 | 87 nt | BASIC | -4,57 | □□□□□ -3,14 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm25465-201 | ENSMUST00000157716 | 105 nt | BASIC | -4,58 | □□□□□ -3,14 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm25049-201 | ENSMUST00000158597 | 73 nt | BASIC | -4,6 | □□□□□ -3,15 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23990-201 | ENSMUST00000117031 | 117 nt | BASIC | -4,62 | □□□□□ -3,15 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23961-201 | ENSMUST00000104685 | 97 nt | BASIC | -4,62 | □□□□□ -3,15 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm13059-201 | ENSMUST00000119881 | 398 nt | BASIC | -4,62 | □□□□□ -3,15 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24916-201 | ENSMUST00000157287 | 79 nt | BASIC | -4,63 | □□□□□ -3,15 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm27845-201 | ENSMUST00000184479 | 114 nt | BASIC | -4,63 | □□□□□ -3,15 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23678-201 | ENSMUST00000083157 | 107 nt | BASIC | -4,66 | □□□□□ -3,15 | | |
Sptan1 | P16546 | Mir466-201 | ENSMUST00000093591 | 73 nt | BASIC | -4,66 | □□□□□ -3,15 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23785-201 | ENSMUST00000116741 | 96 nt | BASIC | -4,66 | □□□□□ -3,16 | | |
Sptan1 | P16546 | Mir1950-201 | ENSMUST00000158526 | 74 nt | BASIC | -4,67 | □□□□□ -3,16 | | |
Sptan1 | P16546 | AL929265.1-201 | ENSMUST00000213427 | 125 nt | BASIC | -4,67 | □□□□□ -3,16 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm11966-201 | ENSMUST00000119907 | 87 nt | BASIC | -4,69 | □□□□□ -3,16 | | |
Sptan1 | P16546 | Mir669p-2-201 | ENSMUST00000103868 | 87 nt | BASIC | -4,69 | □□□□□ -3,16 | | |
Sptan1 | P16546 | Mir669p-1-201 | ENSMUST00000103884 | 87 nt | BASIC | -4,69 | □□□□□ -3,16 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22354-201 | ENSMUST00000083919 | 70 nt | BASIC | -4,7 | □□□□□ -3,16 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm29107-201 | ENSMUST00000190910 | 347 nt | BASIC | -4,71 | □□□□□ -3,16 | | |
Sptan1 | P16546 | Traj43-201 | ENSMUST00000103699 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | -4,74 | □□□□□ -3,17 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24106-201 | ENSMUST00000175498 | 127 nt | BASIC | -4,77 | □□□□□ -3,17 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm27332-201 | ENSMUST00000184893 | 112 nt | BASIC | -4,77 | □□□□□ -3,17 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23044-201 | ENSMUST00000157891 | 100 nt | BASIC | -4,78 | □□□□□ -3,17 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm11042-201 | ENSMUST00000110441 | 120 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | -4,8 | □□□□□ -3,18 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23922-201 | ENSMUST00000178792 | 79 nt | BASIC | -4,81 | □□□□□ -3,18 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24657-201 | ENSMUST00000180085 | 79 nt | BASIC | -4,81 | □□□□□ -3,18 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22996-201 | ENSMUST00000180236 | 79 nt | BASIC | -4,81 | □□□□□ -3,18 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23434-201 | ENSMUST00000157179 | 100 nt | BASIC | -4,82 | □□□□□ -3,18 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm44470-201 | ENSMUST00000203913 | 142 nt | BASIC | -4,83 | □□□□□ -3,18 | | |
Sptan1 | P16546 | Mir1187-201 | ENSMUST00000116936 | 122 nt | BASIC | -4,84 | □□□□□ -3,18 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24498-201 | ENSMUST00000158445 | 102 nt | BASIC | -4,84 | □□□□□ -3,18 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24926-201 | ENSMUST00000178053 | 79 nt | BASIC | -4,85 | □□□□□ -3,19 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22632-201 | ENSMUST00000178266 | 79 nt | BASIC | -4,85 | □□□□□ -3,19 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22491-201 | ENSMUST00000157190 | 102 nt | BASIC | -4,87 | □□□□□ -3,19 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm25132-201 | ENSMUST00000082652 | 107 nt | BASIC | -4,87 | □□□□□ -3,19 | | |
Sptan1 | P16546 | AC160962.3-201 | ENSMUST00000225914 | 112 nt | BASIC | -4,88 | □□□□□ -3,19 | | |
Sptan1 | P16546 | mt-Tf-201 | ENSMUST00000082387 | 68 nt | BASIC | -4,88 | □□□□□ -3,19 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm20473-201 | ENSMUST00000173064 | 112 nt | BASIC | -4,89 | □□□□□ -3,19 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24035-201 | ENSMUST00000082867 | 107 nt | BASIC | -4,9 | □□□□□ -3,19 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22729-201 | ENSMUST00000158088 | 129 nt | BASIC | -4,93 | □□□□□ -3,2 | | |
Sptan1 | P16546 | mt-Nd3-201 | ENSMUST00000082411 | 348 nt | APPRIS P1 BASIC | -4,94 | □□□□□ -3,2 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm10813-201 | ENSMUST00000099936 | 90 nt | BASIC | -5,01 | □□□□□ -3,21 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22555-201 | ENSMUST00000157801 | 62 nt | BASIC | -5,02 | □□□□□ -3,21 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24750-201 | ENSMUST00000157843 | 104 nt | BASIC | -5,02 | □□□□□ -3,21 | | |
Sptan1 | P16546 | Snord70-201 | ENSMUST00000104157 | 87 nt | BASIC | -5,04 | □□□□□ -3,22 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm14837-201 | ENSMUST00000119688 | 206 nt | BASIC | -5,07 | □□□□□ -3,22 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm26259-201 | ENSMUST00000104778 | 97 nt | BASIC | -5,08 | □□□□□ -3,22 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm24457-201 | ENSMUST00000083196 | 105 nt | BASIC | -5,08 | □□□□□ -3,22 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm25920-201 | ENSMUST00000158307 | 99 nt | BASIC | -5,09 | □□□□□ -3,23 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm22679-201 | ENSMUST00000116975 | 100 nt | BASIC | -5,13 | □□□□□ -3,23 | | |
Sptan1 | P16546 | Snord47-201 | ENSMUST00000083034 | 77 nt | BASIC | -5,13 | □□□□□ -3,23 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm27317-201 | ENSMUST00000183533 | 95 nt | BASIC | -5,14 | □□□□□ -3,23 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm25401-201 | ENSMUST00000082975 | 106 nt | BASIC | -5,14 | □□□□□ -3,23 | | |
Sptan1 | P16546 | AC164561.1-201 | ENSMUST00000220414 | 115 nt | BASIC | -5,15 | □□□□□ -3,23 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm25524-201 | ENSMUST00000101821 | 107 nt | BASIC | -5,16 | □□□□□ -3,24 | | |
Sptan1 | P16546 | mt-Tl2-201 | ENSMUST00000082417 | 71 nt | BASIC | -5,19 | □□□□□ -3,24 | | |
Sptan1 | P16546 | Gm23244-201 | ENSMUST00000083375 | 92 nt | BASIC | -5,2 | □□□□□ -3,24 | | |
Sptan1 | P16546 | Mir466h-201 | ENSMUST00000104748 | 81 nt | BASIC | -5,2 | □□□□□ -3,24 | | |
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